Resumen

Halococcus hamelinensis fue la primera arquea aislada de los estromatolitos. Se cree que estos ecosistemas geomicrobianos son algunos de los más antiguos que se conocen en la Tierra y, sin embargo, a pesar de su importancia evolutiva, todavía no se conoce bien el papel de las arqueas en estos sistemas. Aquí se detalla la secuenciación del genoma y el análisis de una arquea aislada de estromatolitos. El genoma de H. hamelinensis consta de 3.133.046 pares de bases con un contenido medio de G C de 60,08 y contenía 3.150 secuencias codificantes u ORFs predichas, de las cuales 2.196 (68,67%) eran genes codificantes de proteínas con asignaciones funcionales y 954 (29,83%) eran de función desconocida. El uso de codones del genoma de H. hamelinensis era coherente con un proteoma altamente ácido, un importante mecanismo de adaptación a la alta salinidad. El transporte y el metabolismo de aminoácidos, el transporte y el metabolismo de iones inorgánicos, la producción y la conversión de energía, la estructura ribosomal y los genes COG de función desconocida estaban sobrerrepresentados. El genoma de H. hamelinensis también reveló características que reflejan su supervivencia en su entorno extremo, incluyendo genes/vías putativas implicadas en la osmoprotección, la respuesta al estrés oxidativo y la reparación de daños por UV. Por último, los análisis del genoma indicaron la presencia de transposasas putativas, así como coincidencias positivas de genes de H. hamelinensis con varios genomas de bacterias, arqueas y virus, lo que sugiere el potencial de transferencia horizontal de genes.

• Materias:Células Enzimas Minería Minas y minería metanogénico Ecología
• Subjects:Cells Enzymes Mining Mines and mining methanogenic Ecology
• Palabras claves:función desconocida cog, coincidencia del gen, respuesta al estrés oxidativo, función del gen cog, hamelinensis, genoma de las bacterias, mecanismo adaptativo principal, reparación de daños por rayos uv, transferencia horizontal de genes, papel de las arqueas
• Keywords:unknown function cog, match of gene, oxidative stress response, function cog gene, hamelinensis, genome of bacteria, major adaptive mechanism, uv damage repair, horizontal gene transfer, role of archaea