Los extremófilos, especialmente los de las arqueas, tienen una miríada de adaptaciones que mantienen sus proteínas celulares estables y activas en las condiciones extremas en las que viven. En lugar de tener un conjunto básico de adaptaciones que funciona para todos los entornos, las Archaea han desarrollado características proteicas separadas que se adaptan a cada entorno. Hemos clasificado las Archaea en tres grupos generales para describir lo que se sabe sobre sus adaptaciones proteicas: termófilas, psicrófilas y halófilas. Las proteínas termófilas tienden a tener un núcleo hidrofóbico prominente y mayores interacciones electrostáticas para mantener la actividad a altas temperaturas. Las proteínas psicrófilas tienen un núcleo hidrofóbico reducido y una superficie proteica menos cargada para mantener la flexibilidad y la actividad a bajas temperaturas. Las proteínas halófilas se caracterizan por tener una mayor carga superficial negativa debido a un mayor contenido de aminoácidos ácidos e inserciones peptídicas, lo que compensa las condiciones iónicas extremas. Mientras que los acidófilos, los alcalifilos y los piezófilos son una clase propia de Archaea, sus adaptaciones proteicas hacia el pH y la presión son menos discernibles. Al comprender las adaptaciones de las proteínas utilizadas por las arqueas extremófilas, esperamos ser capaces de diseñar y utilizar proteínas para aplicaciones industriales, medioambientales y biotecnológicas en las que se requiera una función en condiciones extremas para la actividad.
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