Resumen

El cálculo adecuado de cargas atómicas precisas para los archivos *.itp de topología GROMACS de moléculas pequeñas, generados en el servidor PRODRG, ha sido una tarea complicada hoy en día porque no calcula las cargas atómicas utilizando un método ab initio. Normalmente son necesarios pasos adicionales de optimización de la estructura y cálculo de cargas, seguidos de una tediosa sustitución manual de las cargas atómicas en el fichero *.itp. Para ayudar en esta tarea, presentamos aquí el ITP Adjuster 1.0, un programa de utilidad desarrollado para realizar la sustitución de las cargas PRODRG en los archivos *.itp de moléculas pequeñas por cargas ab initio.

• Materias:Reacciones químicas Biología molecular Química farmacéutica Química analítica Química de los alimentos
• Subjects:Chemical reactions Molecular biology Chemistry pharmaceutical Analytical chemistry Food chemistry
• Palabras claves:archivos .itp, cargas atómicas, moléculas pequeñas, cargas ab initio, método ab initio, cargas atómicas precisas, tediosa sustitución manual, archivo .itp, topología gromacs, ajustador itp
• Keywords:.itp files, atomic charges, small molecules, ab initio charges, ab initio method, accurate atomic charges, tedious manual replacement, .itp file, gromacs topology, itp adjuster