Resumen

El factor de transcripción y el microARN son dos tipos de reguladores clave de la expresión génica. Sus mecanismos reguladores son altamente complejos. En este estudio, proponemos un método computacional para predecir módulos reguladores específicos de condiciones que consisten en microARNs, factores de transcripción y sus genes regulados comúnmente. Utilizamos perfiles de expresión global coincidentes de ARNm y microARNs junto con los objetivos predichos de factores de transcripción y microARNs para construir una red reguladora subyacente. Nuestro método busca módulos altamente puntuados en la red basándose en un método heurístico de dos pasos que combina algoritmos genéticos y de búsqueda local. Utilizando dos conjuntos de datos de expresión coincidentes, demostramos que nuestro método puede identificar módulos altamente puntuados con significancia estadística y relevancia biológica. Los módulos reguladores identificados pueden proporcionar información útil sobre los mecanismos de los factores de transcripción y microARNs.

• Materias:Robots Cuidados pediátricos Experimentos numéricos Radares Factores psicológicos
• Subjects:Robot Pediatric care Numerical experiments Radars Psychological factors
• Palabras claves:Factor de transcripción; MicroARN; Expresión génica; Mecanismos reguladores; Módulos reguladores; Perfiles de expresión global
• Keywords:Transcription factor; MicroRNA; Gene expression; Regulatory mechanisms; Regulatory modules; Global expression profiles