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Artículo

Semiautomated Alignment of High-Throughput Metabolite Profiles with Chemometric ToolsAlineación semiautomatizada de perfiles de metabolitos de alto rendimiento con herramientas quimiométricas

Resumen

El rápido aumento del uso de técnicas de perfilado/huella digital de metabolitos para resolver cuestiones complicadas en metabolómica ha estimulado la demanda de técnicas de procesamiento de datos, como la alineación, para extraer información detallada. En este estudio, se desarrolló un método nuevo y automatizado para corregir el desplazamiento del tiempo de retención de conjuntos de datos de alto rendimiento y alta dimensionalidad. La información de los perfiles cromatográficos objetivo se utilizó para determinar el perfil estándar como referencia para la alineación. Se aplicó una novedosa estrategia de partición de datos por partes para determinar los componentes objetivo en el perfil estándar como marcadores para la alineación. Se propuso un método de búsqueda automatizada de dianas (ATS) para encontrar los tiempos de retención exactos de las dianas seleccionadas en otros perfiles para la alineación. Se empleó la técnica de interpolación lineal (LIT) para alinear los perfiles antes del reconocimiento de patrones, el análisis comparativo exhaustivo y otros pasos del procesamiento de datos. En total, se estudiaron 94 perfiles de metabolitos del ginseng, incluidos los metabolitos secundarios más volátiles. El método utilizado en este artículo podría ser un paso esencial en la extracción de información a partir de datos de alto rendimiento adquiridos en el estudio de la biología de sistemas, la metabolómica y el descubrimiento de biomarcadores.

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