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In silico analysis of potential structural and functional significance of human breast cancer gene BRCA2 sequence variants found in 5 untranslated regionAnálisis in silico de la posible importancia estructural y funcional de las variantes de secuencia del gen BRCA2 del cáncer de mama humano encontradas en la región no traducida de 5

Resumen

Antecedentes y Propósito: BRCA1 y BRCA2 son genes principales que predisponen al cáncer de mama/ovario hereditario, y sus mutaciones aumentan el riesgo de desarrollar cáncer. La prueba genética de estos dos genes se realiza comúnmente hoy en día, pero casi la mitad de las alteraciones genéticas encontradas se declaran como variantes de significado clínico desconocido. La interpretación de estas variantes no clasificadas es la principal preocupación para los genes BRCA. El objetivo de este estudio es investigar la posible significación estructural y funcional de las variantes de secuencia encontradas en la región no traducida 5 (UTR) del gen BRCA2.

Materiales y Métodos: Se construyó la estructura secundaria consensuada de la UTR 5 de BRCA2 basada en secuencias de nucleótidos de cuatro especies diferentes. Recopilamos todas las variantes encontradas en la UTR 5 de BRCA2 humana y exploramos sus posibles efectos al plegar la UTR 5 de BRCA2 humana, incluyendo una de cada variante, utilizando la estructura consensuada como restricción. Si los resultados del plegado restringido dan lugar a una estructura muy diferente de la consensuada, esto podría indicar que esta variante de secuencia particular podría tener un impacto funcional potencial.

Resultados: La mayoría de las alteraciones de secuencia se encuentran cerca del extremo 3 de la UTR 5, en las proximidades del sitio de iniciación de la traducción. Cuatro de ellas: c.-26G>A, c.-26G>C, c.-26G>T y c.-12T>C alteraron notablemente la estructura secundaria consensuada al crear subestructuras con menor energía libre mínima, y por lo tanto, menos estables.

Conclusiones: Como se dedujo previamente en el caso de la variante c.-26G>A, los cambios c.-26G>C, c.-26G>T y c.-12T>C podrían desestabilizar el lazo en las proximidades del sitio de inicio de la traducción, lo que podría aumentar la eficiencia de la traducción y, por ende, incrementar la expresión de BRCA2. En consecuencia, nuestro estudio sugiere que estas tres variantes de secuencia de la UTR 5 de BRCA2 son candidatas adecuadas para una caracterización funcional adicional y, por lo tanto, potencialmente significativas clínicamente.

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Información del documento

  • Titulo:In silico analysis of potential structural and functional significance of human breast cancer gene BRCA2 sequence variants found in 5 untranslated region
  • Autor:Ozretić, Petar; Levačić Cvok, Mirela; Musani, Vesna; Sabol, Maja; Car, Diana; Levanat, Sonja
  • Tipo:Artículo
  • Año:2010
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Maja Herak Bosnar
  • Materias:Acetamida
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