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Artículo

Comparative Analysis of Glycogene Expression in Different Mouse Tissues Using RNA-Seq DataAnálisis comparativo de la expresión de glicogenes en diferentes tejidos de ratón mediante datos de RNA-Seq

Resumen

Los glucogenes regulan una amplia gama de procesos biológicos en el desarrollo de los organismos, así como diferentes enfermedades como el cáncer, el glaucoma primario de ángulo abierto y la disfunción renal. El objetivo de este estudio fue explorar el papel de los glucógenos expresados diferencialmente (DEGGs) en tres tejidos principales como el cerebro, el músculo y el hígado utilizando datos de RNA-seq de ratón, e identificamos 579, 501 y 442 DEGGs para los grupos de cerebro versus hígado (BvL579), cerebro versus músculo (BvM501) e hígado versus músculo (LvM442). El análisis funcional DAVID sugirió que la respuesta inflamatoria, el proceso metabólico de los glicosaminoglicanos y la maduración de proteínas eran los procesos biológicos enriquecidos en BvL579, BvM501 y LvM442, respectivamente. A continuación, estos DEGGs se utilizaron para construir tres redes de interacción mediante GeneMANIA, a partir de las cuales se detectaron genes potenciales como PEMT y HPXN (BvL579), IGF2 y NID2 (BvM501), y STAT6 y FLT1 (LvM442), con el grado más alto. Además, los resultados de nuestro análisis comunitario sugieren que la importancia de los procesos relacionados con el sistema inmunitario en el hígado, los procesos metabólicos glicoesfingolípidos en el desarrollo del cerebro, y los procesos como la proliferación celular, la adhesión y el crecimiento son importantes para el desarrollo muscular. Se necesitan más estudios para confirmar el papel de los genes centrales predichos, así como la importancia de los procesos biológicos.

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