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Comparative Analysis of SWIRM Domain-Containing Proteins in PlantsAnálisis comparativo de las proteínas que contienen dominios SWIRM en plantas

Resumen

Los complejos de remodelación de la cromatina afectan a la expresión génica utilizando la energía de la hidrólisis del ATP para interrumpir o alterar localmente la asociación de las histonas con el ADN. El dominio SWIRM (Swi3p, Rsc8p y Moira) es un dominio alfa-helicoidal de unos 85 residuos en las proteínas cromosómicas. Las proteínas que contienen el dominio SWIRM forman grandes complejos multisubunidad al interactuar con otros factores de modificación de la cromatina y pueden tener una función importante en las plantas. Sin embargo, se sabe poco sobre las proteínas que contienen dominios SWIRM en plantas. En este estudio se identificaron y analizaron 67 proteínas con dominio SWIRM de 6 especies vegetales. Las proteínas de dominio SWIRM de plantas pueden dividirse en tres tipos distintos: Tipo Swi, tipo LSD1 y tipo Ada2. En general, el dominio SWIRM forma un motivo de hélice-giro-hélice que se encuentra comúnmente en las proteínas de unión al ADN. Los genes que codifican las proteínas de dominio SWIRM en Oryza sativa se expresan ampliamente, especialmente en los pistilos. Además, OsCHB701 y OsHDMA701 fueron regulados a la baja por el estrés por frío, mientras que OsHDMA701 y OsHDMA702 fueron inducidos significativamente por el estrés por calor. Estas observaciones indican que las proteínas de dominio SWIRM pueden desempeñar un papel esencial en el desarrollo de las plantas y en sus respuestas al estrés ambiental.

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