Resumen

Los patrones de sustitución de aminoácidos entre el Pyrococcus furiosus no barófilo y su pariente barófilo P. abyssi confirman que los índices de asimetría de la presión hidrostática reflejan el grado de preferencia de los aminoácidos por parte de los organismos arqueos barófilos. Los patrones de sustitución en secuencias proteicas completas, los dominios proteicos compartidos definidos a nivel de superfamilia de pliegues, los dominios en pares de secuencias homólogas y los dominios de origen muy antiguo y muy reciente proporcionan ahora más pistas sobre el entorno que dio lugar al código genético y a la vida diversificada. Los proteomas pirococos son muy similares y comparten un ancestro muy temprano. Los análisis de abundancia relativa de aminoácidos mostraron que los sesgos en el uso de aminoácidos se deben a sus superfamilias de pliegues compartidos. Dentro de estos repertorios, sólo dos de los cinco aminoácidos que son preferentemente barófilos, el ácido aspártico y la arginina, mostraron esta preferencia de forma significativa y consistente a través de la estructura y en los dominios que aparecen en el ancestro. La asparagina, la lisina y la treonina, más primordiales, mostraron una preferencia consistente por la no barofilia a través de la estructura y en el ancestro. Dado que las preferencias barófilas son ya evidentes en dominios antiguos que tienen al menos ~3.000 millones de años, concluimos que la barofilia es un rasgo muy antiguo que se desarrolló simultáneamente con las idiosincrasias genéticas en la convergencia hacia un código universal.

• Materias:Células Minería Rellenos sanitarios Arqueas metanogénico
• Subjects:Cells Mining Landfills Archeas methanogenic
• Palabras claves:aminoácido, dominio, organismos arqueos barófilos, asimetría de la presión hidrostática, secuencia proteica completa, índice de asimetría de la presión, par de secuencias homólogas, análisis de la abundancia de ácidos, patrón de sustitución de ácidos, superfamilia de pliegues compartidos
• Keywords:amino acid, domain, barophilic archaeal organisms, hydrostatic pressure asymmetry, entire protein sequence, pressure asymmetry index, homologous sequence pair, acid abundance analysis, acid substitution pattern, shared fold superfamily