Resumen

La decoloración verde es uno de los problemas más importantes que causan la baja calidad del producto en el procesado del ajo, que puede ser inducida por estrés a baja temperatura. Sin embargo, el mecanismo de la decoloración verde inducida por las bajas temperaturas es poco conocido. En el presente estudio, el ajo de control y tres muestras de ajo tratadas a baja temperatura (almacenadas a 4°C durante 10, 15 y 40 días, respectivamente) se utilizaron para el análisis del perfil transcriptómico de todo el genoma. Se ensamblaron de novo un total de 49280 unigenes de ajo con una longitud media de 1337 pb, 20231 de los cuales se consiguieron para la anotación funcional. Al ser sometido a 10, 15 y 40 días de tratamiento a baja temperatura, se observó un mayor grado de decoloración, y un total de 4757, 4401 y 2034 unigenes mostraron una expresión diferencial, respectivamente. Por último, se hallaron 5923 genes expresados diferencialmente (DEG) que respondían al estrés por baja temperatura, de los cuales 3921 se identificaron en al menos dos tratamientos. Entre estos unigenes que responden al estrés, había un gran número de genes codificadores de enzimas, que enriquecieron significativamente la vía "proteasoma", muchos de los cuales están potencialmente implicados en la decoloración del ajo, como 7 genes codificadores de aliinasa, 5 genes codificadores de γ-glutamiltranspeptidasa y 1 gen codificador de δ-aminolevulínico deshidratasa. Estos genes que codifican enzimas sensibles al estrés son posiblemente responsables de la decoloración del ajo inducida por las bajas temperaturas. La identificación de un gran número de DEGs proporciona una base para elucidar el mecanismo de la decoloración verde inducida por bajas temperaturas en el ajo.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:genes, genes codificantes, decoloración del ajo, decoloración verde, gran número, baja temperatura, estrés por temperatura, análisis amplio de perfiles del transcriptoma, ácido aminolevulínico deshidratasa, DEGs
• Keywords:genes, encoding genes, garlic discoloration, green discoloration, large numbers, low temperature, temperature stress, wide transcriptome profiling analysis, aminolevulinic acid dehydratase, DEGs