Resumen

El oídio es una de las enfermedades más importantes del trigo. En este estudio, se utilizaron muestras de ARN foliar de NILs de trigo portadoras de alelos Pm2 resistentes y susceptibles al oídio (L031 y Chancellor) y de su híbrido F1 en dos puntos temporales (16 h y 96 h postinoculación) para el análisis de ARN-seq. Realizamos comparaciones entre materiales similares en diferentes momentos y entre materiales diferentes en los mismos momentos. Los DEGs solapados entre los fenotipos dominantes (L031 e híbrido F1) y el fenotipo recesivo (Chancellor) fueron 1028 y 2214 DEGs, que eran claramente inferiores a los existentes entre los parentales dominante y recesivo, por lo que podían proporcionar información relativamente precisa y valiosa. Los análisis de enriquecimiento GO y KEGG de los DEG revelaron que, además de los genes relacionados con la defensa esperados, también estaban implicados la regulación diferencial al alza y a la baja de genes de muchas otras redes de señalización. El análisis comparativo del transcriptoma también reveló que la fase temprana de la posinoculación es un punto temporal importante y adecuado para estudiar los perfiles de expresión y las vías de señalización de los genes relacionados con la resistencia tras la inoculación fúngica. Los análisis qRT-PCR mostraron patrones de expresión de genes muy coherentes con los datos de RNA-seq. Los resultados ayudarán a identificar los genes y las vías de señalización implicados en la respuesta al oídio en el trigo.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:genes, DEGs, híbrido F1, análisis comparativo del transcriptoma, análisis de enriquecimiento KEGG, patrones de expresión consistentes, muestras de ARN foliar, respuesta al oídio, puntos temporales adecuados, alelos Pm2 susceptibles.
• Keywords:genes, DEGs, F1 hybrid, Comparative transcriptome analysis, KEGG enrichment analysis, consistent expression patterns, leaf RNA samples, powdery mildew response, suitable time points, susceptible Pm2 alleles