Resumen

Salvia miltiorrhiza Bunge es una importante medicina tradicional china (MTC). En este estudio, se utilizaron dos genotipos de S. miltiorrhiza (BH18 y ZH23) con diferentes concentraciones de ácidos fenólicos para la secuenciación de novo del ARN (ARN-seq). Se obtuvo un total de 170.787 transcritos y 56.216 unigenes. Se identificaron 670 genes de expresión diferencial (DEG) entre BH18 y ZH23, 250 de los cuales estaban regulados al alza en ZH23, siendo los genes implicados en la ruta de biosíntesis de fenilpropanoides los más regulados al alza. Nueve genes implicados en la ruta de biosíntesis de la lignina fueron regulados al alza en BH18, lo que se traduce en un mayor contenido de lignina en BH18. Sin embargo, los perfiles de expresión de la mayoría de los genes implicados en la vía de la biosíntesis de fenilpropanoides fueron mayores en ZH23 que en BH18. Estos resultados indican que los genes implicados en la ruta de biosíntesis de fenilpropanoides pueden desempeñar un papel importante en el metabolismo secundario y demuestran que la biosíntesis de lignina es una ruta que compite parcialmente con la biosíntesis de ácidos fenólicos. Los resultados de este estudio amplían nuestra comprensión de la regulación de la biosíntesis de ácidos fenólicos en S. miltiorrhiza.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:núcleo común aguas arriba de la vía de biosíntesis de fenilpropanoides, BH18, biosíntesis de ácidos fenólicos, ZH23, genes, diferentes concentraciones de ácidos fenólicos, importante medicina tradicional china, genotipos de S. miltiorrhiza, Salvia miltiorrhiza Bunge, ARN de novo.
• Keywords:core common upstream phenylpropanoid biosynthesis pathway, BH18, phenolic acid biosynthesis, ZH23, genes, different phenolic acid concentrations, important traditional Chinese medicine, S. miltiorrhiza genotypes, Salvia miltiorrhiza Bunge, de novo RNA