Se estudiaron los consorcios metanogénicos degradadores de tetrametilamonio de un reactor de mezcla completa de lodos suspendidos (CMSS) y de un reactor de flujo ascendente de lodos anaeróbicos (UASB) utilizando múltiples técnicas moleculares basadas en la PCR y un enfoque proteómico de escopeta. Los genes procarióticos del ARNr 16S de los consorcios se analizaron mediante PCR cuantitativa, secuenciación de alto rendimiento y métodos de clonación DGGE. Los resultados mostraron que las arqueas metanogénicas eran altamente predominantes en ambos reactores pero diferían notablemente según la estructura de la comunidad. Los análisis comunitarios y proteómicos revelaron que Methanomethylovorans y Methanosarcina eran los principales actores en la desmetilación de sustratos metilados y en la formación de metano a través de la vía de reducción de metil-S-CoM y, posiblemente, de las vías relacionadas con la acetil-CoA sintasa/decarbonilasa. A diferencia de la alta dominancia de una población de Methanomethylovorans en el reactor CMSS, diversas especies de Methanosarcina metilotrófica habitaron en asociación sintrofa con Methanobacterium hidrogenotrófica en el lodo granular del reactor UASB. Los resultados generales indicaron las estructuras comunitarias dependientes del reactor de la degradación de las aminas cuaternarias y proporcionaron una visión microbiana para mejorar la comprensión de la aplicación de ingeniería.
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