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Artículo

Coexpression Analysis of Transcriptome on AIDS and Other Human Disease Pathways by Canonical Correlation AnalysisAnálisis de coexpresión del transcriptoma en el sida y otras vías de enfermedad humana mediante análisis de correlación canónica

Resumen

El síndrome de inmunodeficiencia adquirida es una grave enfermedad humana causada por el virus de la inmunodeficiencia humana. Se han caracterizado varios genes humanos como factores genéticos del huésped que influyen en los procesos de la enfermedad del SIDA. Estudios recientes sobre pacientes con SIDA revelaron que una serie de enfermedades se complican con el SIDA. Para resolver la interacción de genes entre el SIDA y las enfermedades que complican, se utilizó un análisis de correlación canónica para identificar la correlación global entre el SIDA y la expresión de genes de otras vías de la enfermedad. Los resultados mostraron que HLA-B, HLA-A, MH9, ZNED1, IRF1, TLR8, TSG101, NCOR2, y GML son los genes clave restringidos por el SIDA altamente correlacionados con otros genes de la vía de la enfermedad. Además, los genes de la vía de varias enfermedades como el asma, la enfermedad tiroidea autoinmune y la malaria estaban globalmente correlacionados con los ARG. Esto sugiere que estas enfermedades son de alto riesgo en pacientes con SIDA como enfermedades complicantes.

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