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The Analysis of Estrogen-Degrading and Functional Metabolism Genes in Rhodococcus equi DSSKP-R-001Análisis de genes degradadores de estrógenos y metabolismo funcional en Rhodococcus equi DSSKP-R-001

Resumen

La contaminación por estrógenos está reconocida como uno de los problemas medioambientales más graves, causante de una preocupación generalizada en todo el mundo. Los estrógenos ambientales proceden principalmente de la excreción humana y de vertebrados, de fármacos y de actividades agrícolas. El uso de microorganismos es actualmente el método más económico y eficaz para la biodegradación de estrógenos ambientales. Rhodococcus equi DSSKP-R-001 (R-001) tiene una gran capacidad de degradación de estrógenos. Nuestro estudio indicó que R-001 puede utilizar diferentes tipos de estrógenos como única fuente de carbono para su crecimiento y metabolismo, con tasas de degradación final superiores al 90%. El análisis del transcriptoma mostró que 720 genes (E1), 983 genes (E2) y 845 genes (EE2) estaban significativamente regulados al alza en el grupo tratado con estrógenos en comparación con el grupo de control, y 270 genes expresados diferencialmente (DEG) estaban regulados al alza en todos los grupos de tratamiento. Estos DEG incluían transportadores ABC; genes degradadores de estrógenos, incluidos los que realizan reacciones iniciales de oxidación y deshidrogenación y los que degradan los sustratos resultantes en pequeñas moléculas; y genes de metabolismo que completan la transformación intracelular y la utilización de metabolitos de estrógenos a través de procesos biológicos como el metabolismo de aminoácidos, el metabolismo de lípidos, el metabolismo de carbohidratos y el ciclo del ácido tricarboxílico. En resumen, la biodegradación de los estrógenos está coordinada por una red metabólica de enzimas degradadoras de estrógenos, transportadores, enzimas metabólicas y otras coenzimas. En este estudio se han analizado por primera vez los mecanismos metabólicos por los que Rhodococcus equi R-001 degrada diversos estrógenos. Se esboza un nuevo sistema de metabolismo de contaminantes, que proporciona un punto de partida para la construcción de bacterias de ingeniería que degraden estrógenos.

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