Resumen

Objetivo. Este estudio tiene por objeto explorar los posibles biomarcadores metabólicos/genéticos, así como las diferencias entre los mecanismos moleculares, de la osteoartritis (OA) y la artritis reumatoide (AR). Métodos. Se descargó el conjunto de datos transcriptómicos GSE100786 para explorar los genes expresados diferencialmente (DEG) entre las muestras de OA y las de AR. Mientras tanto, se descargó el conjunto de datos metabolómicos MTBLS564 y se preprocesó para obtener metabolitos. A continuación, se utilizaron el análisis de componentes principales (PCA) y modelos lineales para revelar las relaciones DEG-metabolitos. Por último, se realizó un análisis de enriquecimiento de vías metabólicas para investigar las diferencias entre los mecanismos moleculares de la OA y la AR. Resultados. Se exploró un total de 976 DEGs y 171 metabolitos entre muestras de OA y muestras de AR. El PCA y el análisis de módulos lineales investigaron 186 interacciones DEG-metabolito incluyendo Glycogenin 1- (GYG1-) asparagine_54, hedgehog aciltransferase- (HHAT-) glucose_70, y TNF receptor-associated factor 3- (TRAF3-) acetoacetate_35. Por último, el análisis de vías KEGG mostró que estos metabolitos estaban principalmente enriquecidos en vías como la unión gap, el fagosoma, NF-kappa B, y la vía IL-17. Conclusiones. Genes como HHAT, GYG1 y TRAF3, así como metabolitos como la glucosa, la asparagina y el acetoacetato, podrían estar implicados en la patogénesis de la OA y la AR. Metabolitos como el etanol y la tirosina podrían participar de forma diferencial en la progresión de la OA y la AR a través de la vía de la unión gap y la vía del fagosoma, respectivamente. La interacción TRAF3-acetoacetato podría estar implicada en la regulación de la inflamación en la OA y la AR por la vía del NF-kappa B y la IL-17.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genómica Inestabilidad genómica Polimorfismo genético
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Genomics Genomic instability Genetic polymorphism
• Palabras claves:metabolitos, muestras de OA, muestras de AR, kappa B, mecanismos moleculares, análisis de enriquecimiento de vías metabólicas, análisis de vías KEGG, conjunto de datos del transcriptoma GSE100786, vía de unión gap, análisis de módulos lineales
• Keywords:metabolites, OA samples, RA samples, kappa B, molecular mechanisms, metabolic pathway enrichment analysis, KEGG pathway analysis, Transcriptome dataset GSE100786, gap junction pathway, linear module analysis