El aluminio ácido (Al) es tóxico para las plantas y afecta enormemente a la producción de cultivos en todo el mundo. Para comprender las respuestas de las plantas a los suelos ácidos y a la toxicidad del aluminio, examinamos la expresión génica global utilizando datos de microarrays en plántulas de alfalfa con el tratamiento ácido-aluminio. Se identificaron 3.926 genes significativamente regulados al alza o a la baja en respuesta a los iones Al3 con un tratamiento de pH 4,5, de los cuales el 66,33% se encontraban en las raíces. Sus categorías funcionales estaban relacionadas principalmente con la regulación de fitohormonas, especies reactivas del oxígeno y transportadores. Tanto el enriquecimiento de la ontología génica (GO) como el análisis KEGG indicaron que la biosíntesis de fenilpropanoides, el metabolismo de la fenilalanina y la biosíntesis de flavonoides desempeñaban un papel crítico en la defensa frente al estrés por aluminio en alfalfa. Además, descubrimos que factores de transcripción como las proteínas de la familia MYB y WRKY también pueden estar implicados en la regulación de las reacciones de las especies reactivas del oxígeno y la biosíntesis de flavonoides. Así, el hallazgo del perfil global de expresión génica proporcionó información sobre los mecanismos de defensa de la planta frente al estrés ácido-Al en alfalfa. La comprensión de los genes reguladores clave y las vías sería ventajoso para mejorar la producción de cultivos no sólo en la alfalfa, sino también en otros cultivos bajo estrés ácido-Aluminio.
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