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Analysis of Gene Expression in an Inbred Line of Soft-Shell Clams (Mya arenaria) Displaying Growth Heterosis: Regulation of Structural Genes and the NOD2 PathwayAnálisis de la expresión génica en una línea endogámica de almejas de caparazón blando (Mya arenaria) con heterosis de crecimiento: Regulación de genes estructurales y de la vía NOD2

Resumen

Mya arenaria es un molusco bivalvo de importancia comercial y económica, actualmente afectado por el calentamiento de los océanos, la acidificación y las especies invasoras. Con el fin de fundamentar los estudios sobre el crecimiento de M. arenaria, seleccionamos y reprodujimos una población de almejas de concha blanda con un fenotipo de crecimiento rápido. Esta población mostró un crecimiento significativamente más rápido (p<0,0001), medido por un 35,4% más de tamaño de la concha. Para evaluar la base biológica de esta heterosis de crecimiento, caracterizamos los transcriptomas completos de seis individuos e identificamos genes expresados diferencialmente mediante RNAseq. Entre las vías expresadas diferencialmente se encontraban las vías de los genes estructurales. También se expresó de forma diferencial la vía del receptor del dominio de oligomerización de unión a nucleótidos 2 (NOD2), que contribuye a determinar el crecimiento, la inmunidad, la apoptosis y la proliferación. Entre los miembros de la vía NOD2 regulados al alza figuraban un subconjunto de isoformas de RIPK2 (expresión media 3,3 veces mayor), ERK/MAPK14 (3,8 veces), JNK/MAPK8 (4,1 veces) y NFκB (4,08 veces). Estos transcriptomas serán recursos útiles tanto para la comunidad acuícola como para los investigadores interesados en los moluscos y la heterosis del crecimiento.

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Información del documento

  • Titulo:Analysis of Gene Expression in an Inbred Line of Soft-Shell Clams (Mya arenaria) Displaying Growth Heterosis: Regulation of Structural Genes and the NOD2 Pathway
  • Autor:John J., Wilson; Janelle, Grendler; Azaline, Dunlap-Smith; Brian F., Beal; Shallee T., Page
  • Tipo:Artículo
  • Año:2016
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
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