Los sistemas de salud nacionales en todos los países no actúan de manera efectiva. Por lo tanto, especialmente se deben considerar estrategias para introducir innovación organizativa en las organizaciones públicas. El problema es cómo organizar la investigación en este campo. Una de las soluciones generalmente aceptadas es el enfoque sistémico de los sistemas de salud. En este documento, se aplican la teoría de sistemas multiagentes y la teoría de sistemas autónomos para analizar los principales tipos de sistemas de salud. Este análisis nos permite considerar las propiedades del sistema: el nivel de autonomía, la disipación de energía en el sistema, la especificidad de la recompensa (en el sentido de la teoría de juegos), el rol funcional de los agentes en el sistema, el nivel de cooperación de los agentes y los retrasos en los flujos de dinero, solicitudes, reglas y controles. Como resultado, se han encontrado y analizado algunas nuevas funcionalidades del sistema de salud a nivel nacional. Los parámetros mencionados son buenas herramientas para analizar la funcionalidad del sistema.
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