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Artículo

Analysis of lncRNA, miRNA, and mRNA Expression Profiling in Type I IFN and Type II IFN Overexpressed in Porcine Alveolar MacrophagesAnálisis de perfiles de expresión de lncRNA, miRNA y mRNA en IFN tipo I e IFN tipo II sobreexpresados en macrófagos alveolares porcinos

Resumen

Los datos actuales sobre la función de los ARN no codificantes (ARNnc), como los microARN (miARN) y los ARN no codificantes largos (lncARN), en la respuesta inmunitaria mediada por interferón (IFN) son escasos. Se trata de un estudio exhaustivo que analiza los perfiles de expresión de lncRNA y miRNA del IFN tipo I y del IFN tipo II en macrófagos alveolares porcinos mediante secuenciación de ARN. Hubo un total de 152 lncRNAs sobreexpresados diferencialmente (DE) y 21 miRNAs DE a través del IFN tipo I y el IFN tipo II en macrófagos alveolares porcinos. La posterior construcción de la red lncRNA-miRNA-mRNA reveló la implicación de 36 lncRNAs DE y 12 miRNAs DE. LncRNAs como el XLOC_211306, XLOC_100516, XLOC_00695, XLOC_149196, y XLOC_014459 se expresaron en mayor grado en el grupo IFN tipo I, mientras que XLOC_222640, XLOC_047290, XLOC_147777, XLOC_162298, XLOC_220210, y XLOC_165237 se expresaron en mayor grado en el grupo IFN tipo II. Se descubrió que estos lncRNAs actuaban como "esponjas" para miRNAs como miR-34a, miR-328, miR-885-3p, miR-149, miR-30c-3p, miR-30b-5p, miR-708-5p, miR-193a-5p, miR-365-5p, y miR-7. Sus genes diana FADS2, XLOC_162298, XLOC_220210 y XLOC_165237 se expresaron en mayor grado en el grupo IFN tipo II. Se descubrió que sus genes diana FADS2, RPS6KA1, PIM1 y NOD1 estaban asociados a varias vías de señalización relacionadas con el sistema inmunitario, como las vías de señalización del receptor NOD-like, Jak-STAT, mTOR y PPAR. Estos experimentos proporcionan un perfil completo de los ARN no codificantes sobreexpresados en macrófagos alveolares porcinos, aportando nuevos conocimientos sobre la respuesta inmunitaria mediada por IFN.

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Información del documento

  • Titulo:Analysis of lncRNA, miRNA, and mRNA Expression Profiling in Type I IFN and Type II IFN Overexpressed in Porcine Alveolar Macrophages
  • Autor:Congcong, Li; Haoyuan, Han; Xiuling, Li; Jiao, Wu; Xinfeng, Li; Hui, Niu; Wantao, Li
  • Tipo:Artículo
  • Año:2021
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genoma Genética vegetal Proteómica
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