Resumen

Antecedentes. El cáncer de mama (BRCA) es uno de los cánceres más frecuentes y la principal causa de muerte relacionada con el cáncer en las mujeres. Las proteínas de unión a ARN (RBP) desempeñan un papel importante en la aparición y patogénesis de tumores. Los ARN diana de las RBP son muy diversos; además de unirse al ARNm, las RBP también se unen al ARN no codificante. El ARN no codificante puede dar lugar a estructuras secundarias que pueden unirse a las RBP y regular múltiples procesos como el splicing, la modificación del ARN, la localización de proteínas y la remodelación de cromosomas, lo que puede conducir a la iniciación, progresión e invasión de tumores. Métodos. (1) Los datos BRCA se descargaron de las bases de datos del Atlas del Genoma del Cáncer (TCGA) y del Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer (ICGC) y se utilizaron como conjuntos de datos de entrenamiento y prueba, respectivamente. (2) Los genes pronósticos relacionados con los RBP se seleccionaron de acuerdo con los genes expresados diferencialmente (DEG) solapados de la base de datos TCGA. (3) Se realizó una regresión univariante de riesgos proporcionales de Cox para identificar los genes con un valor pronóstico significativo. (4) Además, utilizamos la regresión LASSO para construir una firma pronóstica y validamos la firma en la cohorte TCGA e ICGC. (5) Además, también realizamos un análisis pronóstico, una verificación del nivel de expresión, un análisis de correlación de células inmunitarias y un análisis de correlación de fármacos de los genes del modelo. Resultados. Se identificaron cuatro genes (MRPL13, IGF2BP1, BRCA1 y MAEL) como firmas genéticas de pronóstico. El modelo pronóstico ha sido validado en las cohortes TCGA e ICGC. La puntuación de riesgo calculada con cuatro firmas de genes pudo predecir en gran medida la supervivencia global durante 1, 3 y 5 años en pacientes con BRCA. El gráfico de calibración demostró una excelente coherencia entre la predicción y la observación real. Los resultados de la verificación de la base de datos en línea revelaron que estos cuatro genes se expresaban significativamente en los tumores. También se observaron correlaciones significativas con algunas células inmunitarias y correlaciones potenciales con algunos fármacos. Conclusiones. Construimos una firma pronóstica basada en 4-RBPs para predecir el pronóstico de pacientes BRCA, y tiene el potencial para tratar y diagnosticar BRCA.

• Materias:Insuficiencia cardíaca Plataforma de servicios Filtro de orden óptimo Características clínicas Osteoporosis
• Subjects:Heart failure Platform services Optimal order filtering Clinical features Osteoporosis
• Palabras claves:genes, RBPs, BRCA, TCGA, firma pronóstica, Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer, análisis de correlación de células inmunitarias, Atlas del Genoma del Cáncer, análisis de correlación de fármacos, verificación del nivel de expresión
• Keywords:genes, RBPs, BRCA, TCGA, prognostic signature, International Cancer Genome Consortium, immune cell correlation analysis, Cancer Genome Atlas, drug correlation analysis, expression level verification