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Genome Wide Analysis of Nucleotide-Binding Site Disease Resistance Genes in Brachypodium distachyonAnálisis del genoma completo de los genes de resistencia a las enfermedades en Brachypodium distachyon

Resumen

Los genes de resistencia a enfermedades con sitio de unión a nucleótidos (NBS) desempeñan un papel importante en la defensa de las plantas frente a diversos patógenos y plagas de insectos. Se han identificado muchos genes R en diversas especies de plantas. Sin embargo, se sabe poco sobre los genes que codifican NBS en Brachypodium distachyon. En este estudio, utilizando el análisis computacional del genoma de B. distachyon, identificamos 126 genes regulares que codifican NBS y los caracterizamos en base a su diversidad estructural, motivos proteicos conservados, localización cromosómica, duplicaciones génicas, región promotora y relaciones filogenéticas. Los resultados de EST y las secuencias completas de ADNc (de la base de datos de Brachypodium) de 126 candidatos a R-like apoyaron su existencia. Basándose en la presencia de motivos proteicos conservados como coiled-coil (CC), NBS, repetición rica en leucina (LRR), estos genes regulares NBS-LRR se clasificaron en cuatro subgrupos: CC-NBS-LRR, NBS-LRR, CC-NBS y X-NBS. Un análisis más detallado de la expresión de los genes que codifican NBS regulares en la base de datos de Brachypodium reveló que estos genes se expresan en una amplia gama de bibliotecas, incluidas las construidas a partir de diversas etapas de desarrollo, tipos de tejidos y tejidos desafiados o no desafiados por la sequía.

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