Resumen

Paeonia lactiflora es una flor herbácea de la familia Paeoniaceae con semillas latentes tanto en el hipocótilo como en el epicótilo. Se utilizó la secuenciación del transcriptoma de alto rendimiento en dos etapas diferentes de desarrollo de las semillas de P. lactiflora para identificar la latencia de las semillas y los genes relacionados con la germinación. Realizamos un ensamblaje de novo y anotamos un total de 123.577 unigenes, que codificaban 24.688 proteínas putativas con 47 categorías GO. Se anotaron un total de 10.714 unigenes en la base de datos KEGG, y 258 vías estaban implicadas en las anotaciones. En el análisis de enriquecimiento funcional se expresaron de forma diferencial un total de 1.795 genes. Los genes clave para la germinación y la latencia de las semillas, como GAI1 y ARF, se confirmaron mediante el análisis cuantitativo de la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa. Este es el primer informe de secuenciación del transcriptoma de semillas de P. lactiflora. Nuestros resultados proporcionan un marco fundamental y apoyo técnico para la mejora selectiva y el cultivo de Paeonia. Nuestros datos transcriptómicos también sirven de base para futuras investigaciones genéticas y genómicas sobre Paeonia y sus especies estrechamente relacionadas.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:total, transcriptoma de semillas de P. lactiflora, análisis de reacción en cadena de la polimerasa, semillas de P. lactiflora, ensamblaje de novo, diferentes etapas de desarrollo, análisis de enriquecimiento funcional, marco fundamental, mejora selectiva posterior, transcripción inversa cuantitativa.
• Keywords:total, P. lactiflora seed transcriptome, polymerase chain reaction analysis, P. lactiflora seeds, de novo assembly, different developmental stages, functional enrichment analysis, fundamental frame work, further selective breeding, quantitative reverse transcription