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Transcriptome Analysis of Orange Head Chinese Cabbage (Brassica rapa L. ssp. pekinensis) and Molecular Marker DevelopmentAnálisis del transcriptoma de la col china de cabeza naranja (Brassica rapa L. ssp. pekinensis) y desarrollo de marcadores moleculares

Resumen

Debido a su aspecto visual y a su alto contenido en carotenoides, las hojas interiores naranjas son un rasgo deseable para la col china. Para comprender el mecanismo molecular que subyace a la formación de las hojas interiores naranjas, se analizó el gen BrCRTISO (Bra031539), como gen candidato Br-or, entre las variedades blanca y naranja, y se identificaron 7 polimorfismos de nucleótido único (SNP). Sin embargo, sólo un SNP (C952 a T952) alteró la secuencia de aminoácidos, dando lugar a una mutación de Leu318 a Phe318 en las variedades naranjas. Además, analizamos los genes expresados diferencialmente (DEG) entre los individuos F2 naranjas y blancos (14-401 × 14-490) y descubrimos que cuatro genes regulados a la baja estaban implicados en la vía de biosíntesis de carotenoides, lo que puede conducir a la acumulación de prolicopeno y otros pigmentos carotenoides en las hojas interiores naranjas. Además, desarrollamos un nuevo marcador InDel en el primer intrón, que se correlaciona con los fenotipos de las hojas interiores de color naranja. En conclusión, estos hallazgos mejoran nuestra comprensión del mecanismo subyacente de la acumulación de pigmentos en las hojas interiores de la col china. Además, el SNP (C952 a T952) y el marcador InDel facilitarán la selección asistida por marcadores durante la mejora genética de la col china.

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