Resumen

Para dos bibliotecas (PDF1 y ODF1) se utilizó la secuenciación Illumina y se obtuvieron 44.082.301 y 43.708.132 lecturas limpias, respectivamente. Tras ser mapeados en la base de datos RefSeq bovina, se identificaron 15.533 genes expresados en ambos tipos de folículos (corte RPKM > 0,5), de los cuales 719 estaban altamente expresados en los folículos bovinos (corte RPKM > 100). Además, se identificaron 83 genes con expresión diferencial en ODF1 frente a PDF1, de los cuales 42 genes estaban regulados al alza y 41 a la baja. El análisis de vías KEGG reveló dos genes regulados al alza en ODF1 frente a PDF1, CYP11A1 y CYP19A1, que son genes importantes en la vía de biosíntesis de hormonas esteroides. Este estudio representa la primera investigación del transcriptoma de los folículos bovinos en las fases de predesviación e inicio de la desviación y proporciona una base para futuras investigaciones de los mecanismos reguladores implicados en el desarrollo folicular en bovinos.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:genes, ODF1, PDF1, folículos bovinos, vía de biosíntesis de hormonas esteroideas, análisis de vías KEGG, base de datos RefSeq bovina, RPKM, lecturas limpias, etapas de desviación
• Keywords:genes, ODF1, PDF1, bovine follicles, steroid hormone biosynthesis pathway, KEGG pathway analysis, bovine RefSeq database, RPKM, clean reads, deviation stages