Resumen

Radix polygalae, las raíces secas de Polygala tenuifolia y P. sibirica, es una de las plantas medicinales tradicionales chinas más conocidas. Radix polygalae contiene varias saponinas, xantonas y ésteres de oligosacáridos, y estos compuestos son responsables de varias propiedades farmacológicas. Para proporcionar información básica de cultivo, mejorar el análisis biológico molecular y determinar las vías biosintéticas de metabolitos secundarios de P. tenuifolia, aplicamos la tecnología de secuenciación Illumina y el ensamblaje de novo. También aplicamos esta técnica para obtener una visión general del transcriptoma de P. tenuifolia a partir de muestras de diferentes años. Utilizando la secuenciación Illumina, se anotaron aproximadamente el 67,2% de las secuencias únicas mediante búsquedas de similitud con herramientas básicas de búsqueda de alineación local en bases de datos de secuencias públicas. Clasificamos los unigenes anotados utilizando las bases de datos Nr, Nt, GO, COG, y KEGG en comparación con NCBI. También obtuvimos muchos candidatos CYP450s y UGTs mediante el análisis de genes en las vías de biosíntesis de metabolitos secundarios, incluyendo la vía putativa de la biosíntesis de terpenoides y fenilpropanoides. Con esta secuenciación del transcriptoma, se podrán mejorar los futuros estudios genéticos y genómicos relacionados con los mecanismos moleculares asociados a la composición química de P. tenuifolia. Los genes implicados en el enriquecimiento de las vías relacionadas con la biosíntesis de metabolitos secundarios podrían mejorar las aplicaciones potenciales de P. tenuifolia en la industria farmacéutica.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Proteomics Genetic transcription
• Palabras claves:P. tenuifolia, Radix polygalae, vías biosintéticas, metabolito secundario, herramienta básica de búsqueda de alineamiento local búsquedas de similitud, plantas medicinales tradicionales chinas, transcriptoma de P. tenuifolia, información básica de cultivo, muchos candidatos CYP450s, análisis biológico molecular.
• Keywords:P. tenuifolia, Radix polygalae, biosynthetic pathways, secondary metabolite, basic local alignment search tool similarity searches, traditional Chinese medicinal plants, P. tenuifolia transcriptome, basic breeding information, many candidates CYP450s, molecular biological analysis