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Artículo

Transcriptome Analysis of the Thymus in Short-Term Calorie-Restricted Mice Using RNA-seqAnálisis del transcriptoma del timo en ratones con restricción calórica a corto plazo mediante RNA-seq

Resumen

La restricción calórica (RC), que es un factor que amplía la esperanza de vida y un actor importante en la respuesta inmunitaria, es un método protector eficaz contra el desarrollo del cáncer. El timo, que desempeña un papel fundamental en el desarrollo del sistema inmunitario, reacciona rápidamente a la deficiencia nutricional. En este estudio se realizó la secuenciación del transcriptoma basada en RNA-seq en tejidos del timo de ratones MMTV-TGF-α sometidos a dietas ad libitum (AL), restricción calórica crónica (CCR) y restricción calórica intermitente (ICR). Se secuenciaron tres bibliotecas de ADNc utilizando Illumina HiSeq™ 4000 para producir lecturas de 100 pares de bases. En promedio, se mapearon 105 millones de lecturas limpias y en total se identificaron 6091 genes significativamente expresados de forma diferencial (DEGs) (p<0,05). Estos DEG se agruparon en categorías de la Ontología Genética (GO). El patrón de expresión revelado por RNA-seq fue validado por análisis de PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) de cuatro genes importantes, que son leptina, ghrelina, Igf1 y adinopectina. Los datos de RNA-seq se han depositado en la base de datos NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) (GSE95371). Informamos del uso de la secuenciación de ARN para encontrar DEGs que se ven afectados por diferentes regímenes de alimentación en el timo.

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