La caña de azúcar es el cultivo de azúcar y bioenergía más importante del mundo. La selección y combinación de progenitores para el cruce se basan en la comprensión de sus estructuras genéticas y diversidad molecular. En el presente estudio, se genotiparon 115 genotipos de caña de azúcar utilizados para el cruce parental basados en cinco loci de marcadores de repetición de secuencias simples genómicas (gSSR) y 88 alelos polimórficos de loci (100%) detectados por electroforesis capilar. Los valores de los parámetros de diversidad genética en las poblaciones indican que la variación genética intrapoblacional (90.5%) fue mucho mayor que la interpopulacional (9.5%). El análisis de conglomerados reveló que había tres grupos denominados grupos I, II y III dentro de los 115 genotipos. Los genotipos liberados por cada programa de cría mostraron relaciones genéticas más cercanas, excepto la serie YC liberada por la estación de cría de
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