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Spectroscopic Study of Cytosine Methylation Effect on Thermodynamics of DNA Duplex Containing CpG MotifEstudio Espectroscópico del Efecto de la Metilación de la Citosina en la Termodinámica del Dúplex de ADN que Contiene el Motivo CpG

Resumen

El efecto de la metilación de la citosina en los dúplex de ADN fue estudiado utilizando un sistema modelo de tres octámeros de ADN auto complementarios que contienen un motivo central CpG rodeado por un par de pares de bases AT, CAACGTTG, CATCGATG y CTTCGAAG, y sus análogos con la citosina central metilada en la posición C5. Las dependencias de la temperatura de las espectros de RMN de H, absorción UV y dispersión Raman medidas en soluciones acuosas a concentraciones de diferentes órdenes de magnitud fueron sometidas a un análisis conjunto que permitió una determinación precisa de la entalpía y entropía de la formación del dúplex. Se reveló que los cambios en las contribuciones de entalpía y entropía dependen fuertemente de la composición de las bases en la vecindad del motivo CpG.

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