Resumen

Hasta hace poco, los experimentos con microarrays solían incluir relativamente pocas matrices con una única representación de cada gen en cada una de ellas. Con el fin de comparar la expresión génica de una cianobacteria marina y una cepa mutante knockout en un medio artificial definido de agua de mar, se desarrolló una micromatriz de genoma completo con múltiples puntos por gen (distribuidos espacialmente por toda la matriz). Se desarrollaron métodos estadísticos para el análisis en la situación especial de este estudio de caso en el que hay replicación de genes dentro de un array y en el que se utilizan relativamente pocos arrays, como puede ser el caso con la tecnología actual de arrays. Debido en parte a la replicación dentro de una matriz, fue posible detectar cambios muy pequeños en los niveles de expresión entre las cepas silvestres y mutantes. Un resultado biológico interesante de este experimento es la indicación de hasta qué punto el sistema regulador del fósforo de esta cianobacteria afecta a la expresión de múltiples genes más allá de los estrictamente implicados en la adquisición de fósforo.

• Materias:Biología molecular Biogénesis Proliferación celular Genómica Inestabilidad genómica
• Subjects:Molecular biology Biogenesis Cell proliferation Genomics Genomic instability
• Palabras claves:array, pocos arrays, medio artificial de agua de mar, microarray de genoma completo, tecnología actual de arrays, resultado biológico interesante, cepa mutante knockout, expresión, gen, Métodos estadísticos
• Keywords:array, few arrays, artificial seawater medium, complete genome microarray, current array technology, interesting biological outcome, knockout mutant strain, expression, gene, Statistical methods