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Comprehensive Analysis of TIFY Transcription Factors and Their Expression Profiles under Jasmonic Acid and Abiotic Stresses in WatermelonAnálisis exhaustivo de los factores de transcripción TIFY y sus perfiles de expresión bajo estrés por ácido jasmónico y estrés abiótico en sandía

Resumen

La familia de genes TIFY es específica de plantas y codifica proteínas implicadas en la regulación de múltiples procesos biológicos. Aquí, identificamos 15 genes TIFY en el genoma de la sandía, que se dividieron en cuatro subfamilias (ocho JAZ, cuatro ZML, dos TIFY y un PPD) en el árbol filogenético. Los genes ClTIFY se localizaron de forma desigual en ocho cromosomas, y se identificaron tres eventos de duplicación segmentaria y un evento de duplicación en tándem, lo que sugiere que la duplicación de genes desempeña un papel vital en la expansión de la familia de genes TIFY en sandía. Un análisis más detallado de las arquitecturas proteicas, los dominios conservados y las estructuras génicas proporcionó pistas adicionales para comprender las funciones putativas de los miembros de la familia TIFY. El análisis de los datos qRT-PCR y RNA-seq reveló que los genes ClTIFY detectados tenían una expresión preferente en tejidos específicos. El análisis qRT-PCR reveló que nueve genes TIFY seleccionados respondían al ácido jasmónico (JA) y a estreses abióticos como la sal y la sequía. El JA activó ocho genes y suprimió uno, entre los cuales ClJAZ1 y ClJAZ7 fueron los más significativamente inducidos. El estrés por sal y sequía activó casi todos los genes detectados en diferentes grados. Estos resultados sientan las bases para una mayor caracterización funcional de los genes de la familia TIFY en Citrullus lanatus.

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