Resumen

N. gonorrhoeae y N. meningitidis, los dos únicos patógenos humanos de Neisseria, son especies estrechamente emparentadas. Pero los nichos en los que sobreviven y sus características patógenas son claramente diferentes. Sin embargo, aún no se ha dilucidado del todo la base genética de estas diferencias. En este estudio, se realizó un análisis genómico comparativo basado en 15 genomas de N. gonorrhoeae, 75 de N. meningitidis y 7 de Neisseria no patógena. El análisis del núcleo-pangenoma encontró 1111 familias de genes conservados entre ellos, y cada uno de estos grupos de especies tenía un pangenoma de apertura. Descubrimos que 452, 78 y 319 familias de genes eran únicas en N. gonorrhoeae, N. meningitidis y ambas, respectivamente. Estas familias genéticas únicas se consideraron candidatas relacionadas con su patogenicidad y adaptación al nicho. Las relaciones entre ellas se han verificado en parte mediante análisis de anotación funcional. Sin embargo, al menos un tercio de los genes de cada grupo no ha encontrado información funcional segura. La repetición de secuencia simple (SSR), la base de la variación de fase de los genes, se encontró abundante en la membrana o genes relacionados de cada conjunto único de genes, lo que puede facilitar su adaptación a entornos variables de acogida. El análisis de la interacción proteína-proteína (PPI) encontró al menos cinco grupos distintos de PPI en N. gonorrhoeae y cuatro en N. meningitides, y 167 y 52 proteínas con función desconocida estaban contenidas en ellos, respectivamente.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:N. gonorrhoeae, N. meningitidis, familias de genes, repetición de secuencia simple, cierta información funcional, análisis genómico comparativo, agrupaciones PPI distintas, análisis de anotación funcional, variación de fase génica, genomas de Neisseria no patógenos.
• Keywords:N. gonorrhoeae, N. meningitidis, gene families, Simple sequence repeat, certain functional information, comparative genomics analysis, distinct PPI clusters, functional annotation analysis, gene phase variation, nonpathogenic Neisseria genomes