Rhodococcus equi, miembro del género Rhodococcus, es una bacteria patógena grampositiva. Rhodococcus posee un pangenoma abierto que constituye la base de su elevada diversidad genómica y le permite adaptarse a condiciones de nicho específicas y a los entornos cambiantes de los hospedadores. Nuestro análisis demostró además que el genoma central de R. equi contribuye a la patogenicidad y la adaptación al nicho de R. equi. El análisis genómico comparativo reveló que los genomas de R. equi compartían una relación de colinealidad idéntica, y que la heterogeneidad se adquiría principalmente por medio de islas genómicas y profagos. Además, las islas genómicas en R. equi siempre estaban implicadas en la virulencia, la resistencia o la adaptación al nicho y posiblemente colaboraban con los profagos para causar la mayor parte de la expansión del genoma. Estos hallazgos proporcionan una visión de la diversidad genómica, la evolución y la variación estructural de R. equi y un valioso recurso para estudios de genómica funcional.
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