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Genomewide Analysis of Carotenoid Cleavage Dioxygenases in Unicellular and Filamentous CyanobacteriaAnálisis genómico de las dioxigenasas de escisión de carotenoides en cianobacterias unicelulares y filamentosas

Resumen

Las dioxigenasas de escisión de carotenoides (ccd) son un grupo de enzimas que catalizan los pasos de escisión oxidativa de los carotenoides a varios productos de escisión de carotenoides. Se han identificado algunos genes ccd y se han caracterizado funcionalmente enzimas codificadas en muchas plantas superiores, pero poco en cianobacterias. Hemos realizado un análisis comparativo de las secuencias de ccd y explorado su distribución, clasificación, filogenia, evolución y estructura en 37 cianobacterias. Se identificaron un total de 61 secuencias putativas de ccd, abundantes en Acaryochloris marina MBIC 11017, cianobacterias filamentosas fijadoras de N2 y cianobacterias unicelulares Cyanothece. Según los árboles filogenéticos de 16S rDNA y CCD, los genes nced y ccd8 son posteriores a la divergencia de ccd7, apco y ccd1. Todas las enzimas CCD comparten dominios de estructura básica conservados constituidos por un único bucle formado por siete hebras β y una hélice. En este trabajo, se ha revelado un marco general de conexión secuencia-función-evolución para la ccd, que puede proporcionar nuevos conocimientos para la investigación funcional.

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