Resumen

En este estudio aislamos una nueva bacteria degradadora de estrógenos a partir de una muestra de suelo recogida cerca de una fábrica farmacéutica de Pekín (China). Las observaciones morfológicas, los análisis fisiológicos y bioquímicos y el análisis de secuencias mostraron que la cepa pertenecía al género Acinetobacter, y se denominó DSSKY-A-001. La tasa de degradación de estrógenos y la densidad de crecimiento de la cepa DSSKY-A-001 se determinaron mediante cromatografía líquida de alto rendimiento y un ensayo de crecimiento utilizando un lector de microplacas, respectivamente. La tasa de degradación de estrógenos fue del 76% al tercer día y del 90% al sexto día de cultivo. Se detectaron tres tipos de intermediarios del metabolismo de estrógenos mediante cromatografía líquida de alto rendimiento y espectrometría de masas, y se predijeron la vía metabólica de los estrógenos y las posibles enzimas degradadoras de estrógenos. Se utilizó RT-PCR para verificar si las tres enzimas putativas, catecol 1,2-dioxigenasa, dioxigenasa y 7α-hidroxiesteroide deshidrogenasa, se expresaban en la cepa. Los resultados de la validación fueron coherentes con las predicciones de que estas tres enzimas estaban presentes y se expresaban en Acinetobacter DSSKY-A-001. Para comprender mejor la actividad de degradación de estrógenos de la cepa a nivel genético, secuenciamos el genoma y realizamos una anotación funcional de genes. Mediante este análisis de la secuencia génica, identificamos genes que se predijo que codificarían las enzimas detectadas anteriormente, catecol 1,2-dioxigenasa, dioxigenasa y 7α-hidroxiesteroide deshidrogenasa, así como otras seis enzimas que podrían estar implicadas en la degradación de estrógenos. Por lo tanto, se encontró un total de nueve enzimas relacionadas con la degradación de estrógenos.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:tasa de degradación de estrógenos, dioxigenasa, enzimas, A-001, cepa, degradación de estrógenos, hidroxiesteroide deshidrogenasa, cromatografía líquida, intermediarios del metabolismo de estrógenos, anotación funcional de genes
• Keywords:estrogen degradation rate, dioxygenase, enzymes, A-001, strain, estrogen degradation, hydroxysteroid dehydrogenase, liquid chromatography, estrogen metabolism intermediates, functional gene annotation