La tumorigénesis es un complejo proceso biológico dinámico que incluye múltiples pasos de alteraciones genéticas y epigenéticas, expresión aberrante de ARN no codificante y cambios en los perfiles de expresión de genes codificantes. Llamamos "iniciatoma del cáncer" al conjunto de esas perturbaciones en el espacio genómico. Los ARN no codificantes largos (lncARN) se transcriben de forma omnipresente en el genoma y tienen funciones reguladoras clave en la remodelación de la cromatina y la expresión génica. Se han observado variaciones espaciotemporales en la expresión de los lncARN en el desarrollo y en estados patológicos como el cáncer. Se han estudiado algunos lncRNAs desregulados en cánceres, pero el papel de los lncRNAs en el iniciatoma del cáncer sigue siendo en gran parte desconocido, especialmente en el carcinoma esofágico de células escamosas (ESCC). Se realizó un cribado genómico de la expresión de lncRNAs y RNAs codificantes de ESCC y tejidos normales adyacentes no neoplásicos. Identificamos lncRNAs y RNAs codificantes expresados de forma diferencial en el CCEE en relación con sus homólogos de tejido normal y validamos el resultado mediante el análisis de reacción en cadena de la polimerasa. Además, identificamos lncRNAs diferencialmente expresados que están co-localizados y co-expresados con RNAs codificantes diferencialmente expresados en ESCC y los resultados apuntan a una interacción potencial entre lncRNAs y genes codificantes vecinos que afectan al metabolismo de lípidos de éter, y la interacción puede contribuir al desarrollo de ESCC. Estos datos proporcionan pruebas convincentes de un posible nuevo biomarcador genómico del cáncer de células escamosas de esófago.
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