Resumen

Introducción. Desde 2001, año en que se aisló el metapneumovirus humano (HMPV) en los Países Bajos, el virus se ha detectado en varios continentes. Aunque los informes han confirmado la prevalencia del HMPV en todo el mundo, los datos procedentes de Egipto siguen siendo limitados. El HMPV desempeña un papel importante en las infecciones de las vías respiratorias en individuos de todas las edades, especialmente en niños. El objetivo de este estudio era estimar la prevalencia del HMPV en pacientes con infección respiratoria inferior adquirida en la comunidad en el Alto Egipto y caracterizar por primera vez las cepas egipcias circulantes del HMPV. Materiales y métodos. De 2005 a 2008, se analizaron muestras respiratorias de 520 pacientes para detectar la presencia del HMPV mediante RT-PCR en tiempo real. Se realizaron análisis moleculares y filogenéticos de secuencias parciales de genes de fusión de pacientes HMPV-positivos. Resultados. En 2007-2008 se detectaron pacientes positivos para el HMPV. La tasa global de infección fue del 4%, mientras que el 57% de los pacientes eran niños. El análisis de secuencias demostró la circulación de virus del subgrupo B con predominio del linaje B2. La identidad de secuencias nucleotídicas dentro del linaje B1 fue del 98,8%-99,7 nd superior a la del linaje B2 (94,3%-100%). Se observaron tres nuevas sustituciones de aminoácidos (T223N, R229K y D280N) del linaje B2. Conclusiones. El HMPV es un patógeno viral importante en la población egipcia, especialmente en niños. Durante 2007-2008, en el Alto Egipto circuló predominantemente el HMPV B2.

• Materias:Microbiología de alimentos Microbiología Bacteriología Genética microbiana Infectología
• Subjects:Food microbiology Microbiology Bacteriology Microbial genetics Infectious disease medicine
• Palabras claves:HMPV, linaje B2, niños, pacientes, Alto Egipto, pacientes positivos, nuevas sustituciones de aminoácidos, secuencias parciales del gen de fusión, cepas egipcias del HMPV, Identidad de secuencia nucleotídica
• Keywords:HMPV, lineage B2, children, patients, Upper Egypt, positive patients, new amino acid substitutions, partial fusion gene sequences, Egyptian HMPV strains, Nucleotide sequence identity