Resumen

Una cisteína conservada modificada por lípidos que se encuentra en un motivo proteico comúnmente denominado lipobox media el anclaje a la membrana de un subconjunto de proteínas transportadas a través de la membrana citoplasmática bacteriana mediante la vía Sec. Los genomas secuenciados de las haloarqueas codifican muchas supuestas lipoproteínas y estudios recientes han confirmado la importancia de la cisteína conservada de la lipobox para el procesamiento del péptido señal de tres proteínas que contienen lipobox en la arquea modelo Haloferax volcanii. Hemos ampliado estos análisis in vivo a otros sustratos de Hfx. volcanii, apoyando nuestras anteriores predicciones in silico y confirmando la diversidad de las lipoproteínas predichas de Hfx. volcanii. Además, mediante amplios análisis comparativos del secretoma, hemos identificado genes que codifican supuestas lipoproteínas en una amplia gama de especies arqueas. Mientras que nuestros análisis in silico, apoyados por los datos in vivo, indican que la mayoría de las lipoproteínas haloarqueas son sustratos de Tat, estos análisis también predicen que muchas especies crenarqueas carecen de lipoproteínas por completo y que otras arqueas, como las especies euryarqueas no halófilas, transportan lipoproteínas a través de la vía Sec. Para facilitar la identificación de los genes que codifican potenciales lipoproteínas Tat haloarqueas, hemos desarrollado TatLipo, una herramienta bioinformática diseñada para detectar lipoboxes en los péptidos señal Tat haloarqueas. Nuestros resultados proporcionan una base sólida para futuros estudios destinados a identificar los componentes de la vía de biogénesis de las lipoproteínas arqueas.

• Materias:Biología Metano Ácido desoxirribonucleico (ADN) Metabolismo Metabolismo (Bioquimica) Arqueas metanogénico
• Subjects:Biology Methane Deoxyribonucleic acid (DNA) Metabolism Metabolism (Biochemistry) Archeas methanogenic
• Palabras claves:vía de la sec, subconjunto de proteínas, genoma secuenciado de haloarqueas, especies de euryarqueas no halófilas, muchas especies de crenarqueas, identificación del gen, gama de arqueas, vía de biogénesis de las lipoproteínas, posible tat de haloarqueas, muchas lipoproteínas putativas
• Keywords:sec pathway, subset of protein, sequenced haloarchaeal genome, nonhalophilic euryarchaeal species, many crenarchaeal species, identification of gene, range of archaeal, lipoprotein biogenesis pathway, potential haloarchaeal tat, many putative lipoprotein