Los recientes avances en los estudios funcionales del ARN ponen de relieve el papel fundamental de estas moléculas en la fisiología celular. Se han implementado diversos métodos para medir los niveles de expresión de varias especies de ARN, utilizando ARN purificado o células fijas. A pesar de que las células fijas ofrecen la posibilidad de observar la distribución espacial del ARN, para comprender mejor el papel de la dinámica del ARN en las funciones celulares se necesitan ensayos con capacidad para monitorizar en tiempo real el transporte de ARN a células vivas. Las balizas moleculares (MB) son oligonucleótidos estructurados en forma de horquilla con un quencher fluorescente en un extremo y un colorante fluorescente (también llamado reportero o fluoróforo) en el extremo opuesto. Esta estructura permite que los MB, en ausencia de su secuencia complementaria diana, no emitan fluorescencia. Al unirse a las dianas, las MB emiten fluorescencia, debido a la separación espacial del quencher y el reporter. Las balizas moleculares son sondas prometedoras para el desarrollo de técnicas de obtención de imágenes de ARN; sin embargo, aún queda mucho trabajo por hacer para obtener una tecnología robusta que permita obtener imágenes de varias moléculas de ARN juntas en tiempo real y en células vivas. El presente trabajo se centra en los diferentes requisitos necesarios para utilizar con éxito las MB en estudios celulares, resumiendo los avances recientes en este campo.
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