Resumen

La dihidropirimidinasa, una dimetaloenzima que contiene una lisina carboxilada en el sitio activo, es un miembro de la familia de las amidohidrolasas cíclicas, que también incluye la alantoinasa, la dihidroorotasa, la hidantoinasa y la imidasa. A diferencia de todas las dihidropirimidinasas conocidas, que son tetraméricas, la dihidropirimidinasa pseudomónica forma un dímero a pH neutro. En este trabajo, presentamos la estructura cristalina de la dihidropirimidinasa de P. aeruginosa a pH 5,9 (entrada PDB 5YKD). Los cristales de la dihidropirimidasa de P. aeruginosa pertenecen al grupo espacial C2221 con dimensiones de celda de a = 108,9, b = 155,7 y c = 235,6 Å. La estructura de la dihidropirimidasa de P. aeruginosa se resolvió con una resolución de 2,17 Å. Una unidad asimétrica del cristal contenía cuatro monómeros de dihidropirimidasa de P. aeruginosa cristalográficamente independientes. El análisis cromatográfico por filtración en gel de la dihidropirimidasa de P. aeruginosa purificada reveló una mezcla de dímeros y tetrámeros a pH 5,9. Así, la dihidropirimidasa de P. aeruginosa puede formar un tetrámero estable tanto en estado cristalino como en solución. Basándose en el análisis de la secuencia y la comparación estructural de la interfaz dímero-dímero entre la dihidropirimidasa de P. aeruginosa y la dihidropirimidasa de Thermus sp., se proponen diferentes mecanismos de oligomerización.

• Materias:Ácidos Ingeniería biomédica Nanopartículas Ácido desoxirribonucleico (ADN)
• Subjects:Acids Biomedical engineering Nanoparticles Deoxyribonucleic acid (DNA)
• Palabras claves:aeruginosa dihidropirimidinasa, mecanismo de oligomerización diferente, mezcla de dímero, monómero de aeruginosa dihidropirimidinasa, grupo espacial c2221, entrada pdb 5ykd, familia de amidohidrolasas cíclicas, análisis cromatográfico, sitio activo, tetrámero estable
• Keywords:aeruginosa dihydropyrimidinase, different oligomerization mechanism, mixture of dimer, aeruginosa dihydropyrimidinase monomer, space group c2221, pdb entry 5ykd, cyclic amidohydrolase family, chromatographic analysis, active site, stable tetramer