El alcaloide isoquinoleína natural berberina posee potencial para tratar la enfermedad de Alzheimer (EA) al dirigirse a múltiples factores patogénicos. En el presente estudio, se realizaron simulaciones de acoplamiento para obtener una comprensión más profunda de la base molecular de los efectos inhibitorios de la berberina contra las enzimas patogénicas importantes de la EA, es decir, acetilcolinesterasa, butirilcolinesterasa y dos isoformas de monoaminooxidasa. Se encontró que las afinidades teóricas de unión de la berberina a las cuatro enzimas son muy cercanas a los valores experimentales, lo que valida la metodología. Una inspección adicional de los modos de unión reveló que las interacciones hidrofóbicas entre la superficie hidrofóbica de la berberina y los residuos hidrofóbicos vecinos son las principales fuerzas que contribuyen a las interacciones ligando-receptor. Aunque el catión de berberina también tiene potencial para formar interacciones electrostáticas con resid
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