La presencia de una fracción no proteinogénica en un péptido no estándar suele mejorar las propiedades biológicas del péptido. Por ello, las bibliotecas de péptidos no estándar se utilizan para obtener moléculas valiosas para aplicaciones biológicas, terapéuticas y de diagnóstico. Se pueden generar bibliotecas de péptidos no estándar muy diversas modificando química o enzimáticamente las bibliotecas de péptidos estándar sintetizadas por la maquinaria ribosómica, mediante modificaciones postraduccionales. Alternativamente, se han desarrollado estrategias de codificación de aminoácidos no proteinogénicos en el código genético para la síntesis ribosómica directa de bibliotecas de péptidos no estándar. En las estrategias para la expansión del código genético, los aminoácidos no proteinogénicos se asignan a los codones sin sentido o a los codones de 4 bases para añadir estos aminoácidos al código genético universal. En cambio, en las estrategias de reprogramación del código genético, algunos aminoácidos proteinogénicos se borran del código genético y los aminoácidos no proteinogénicos se reasignan a los codones sin sentido. Aquí se analiza la generación de bibliotecas de péptidos no estándar codificados genéticamente mediante estas estrategias y también se revisan las aplicaciones recientes de estas bibliotecas a la selección de péptidos no estándar funcionales.
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