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Por miles de años, los microorganismos han sido utilizados para proveer productos como el pan, la cerveza y el vino. Una segunda fase de la biotecnología microbiana tradicional tuvo lugar durante la Primera Guerra Mundial en el desarrollo de fermentaciones de acetona-butanol y glicerol, así como procesos para generar ácido cítrico, vitaminas y antibióticos. En la década de los setenta, la microbiología industrial tradicional se fusionó con la biología molecular para elaborar más de cuarenta productos biofarmacéuticos. En la actualidad, la microbiología es un participante principal en la industria global, especialmente en los sectores químico, farmacéutico y de alimentos.
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