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Gene Characteristics and Prognostic Values of m6A RNA Methylation Regulators in Nonsmall Cell Lung CancerCaracterísticas génicas y valores pronósticos de los reguladores de la metilación del ARN m6A en el cáncer de pulmón de células no pequeñas

Resumen

Antecedentes. La N6-metiladenosina (m6A) es la modificación interna más común presente en los ARNm y los ARN no codificantes largos (lncARN), asociada con la tumorigénesis y la progresión del cáncer. Sin embargo, poco se sabe acerca de las funciones de m6A y sus genes reguladores en el cáncer de pulmón no microcítico (CPNM). Aquí, exploramos sistemáticamente las funciones y la importancia pronóstica de los genes reguladores asociados a m6A en el CPNM. Métodos. La variación del número de copias (VNC), la mutación, los datos de expresión de ARNm y la correspondiente información de patología clínica de 1057 pacientes con CPNM se descargaron de la base de datos del atlas del genoma del cáncer (TCGA). Los niveles de ganancia y pérdida de CNV se determinaron utilizando el análisis de segmentación y el algoritmo GISTIC. El GSEA se llevó a cabo para explorar las funciones relacionadas con los diferentes niveles de genes reguladores m6A. Se utilizó el test de Logrank para evaluar la importancia pronóstica de las CNV de genes relacionados con m6A. Resultados. Las alteraciones genéticas de diez reguladores asociados a m6A se identificaron en 102 muestras independientes de CPNM y se relacionaron significativamente con el estadio avanzado del tumor. Las deleciones o deleciones superficiales se correspondían con una menor expresión de ARNm, mientras que las ganancias de número de copias o amplificaciones se relacionaban con una mayor expresión de ARNm de los genes reguladores de m6A. El análisis de supervivencia mostró que los pacientes con pérdida del número de copias de FTO presentaban una peor supervivencia libre de enfermedad (SLE) o supervivencia global (SG). Además, la pérdida del número de copias de YTHDC2 también se asoció a una peor SG en pacientes con CPNM. Por otra parte, la alta expresión de FTO se asoció significativamente con la fosforilación oxidativa, la traducción y el metabolismo del ARNm. Conclusiones. Nuestros hallazgos proporcionan una nueva perspectiva para comprender mejor el papel de los reguladores m6A y la modificación epigenética del ARNm en la patogénesis del CPNM.

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