En este estudio se buscó determinar el grado de variación genética entre cubios (Tropaeolum tuberosum) en un microcentro de diversidad del departamento de Boyacá, Colombia, con marcadores morfológicos y moleculares ISSR (Inter Simple Sequence Repeats). Se colectaron 25 morfotipos de cubio en diferentes fincas de los municipios de Belén y Ventaquemada en Boyacá y se sembraron para su posterior caracterización morfológica y molecular. Las características del tubérculo se evaluaron de acuerdo con los descriptores del Centro Internacional de la Papa, a saber, color predominante de la superficie del tubérculo, color secundario de la superficie del tubérculo, distribución del color secundario de la superficie del tubérculo, color predominante de la pulpa del tubérculo, color secundario de la pulpa del tubérculo, distribución del color secundario de la pulpa del tubérculo, forma del tubérculo y profundidad de los ojos del tubérculo. La variación molecular se evaluó mediante ocho cebadores ISSR. Las caracterizaciones morfológicas y moleculares nos permitieron identificar 25 morfotipos de cubio con variación genética significativa en el área de estudio. Es probable que este hallazgo se atribuya a mecanismos que mantienen la variabilidad genética, como los cruces naturales entre morfotipos modulados por las condiciones ambientales y las prácticas agrícolas locales, incluido el intercambio de semillas y la preferencia por determinados morfotipos.
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