Resumen

Se determinó la secuencia completa del genoma de la cepa DM2 de Bacillus subtilis aislada de un suelo contaminado por petróleo en la meseta tibetana. El genoma de la cepa DM2 consta de un cromosoma circular de 4.238.631 pb para 4.458 genes codificadores de proteínas y un plásmido de 84.240 pb que codifica 103 genes. En el genoma se encuentran 34 islas genómicas que codifican 330 proteínas y 5 profagos. El valor DDH muestra que la cepa DM2 pertenece a la subespecie B. subtilis subsp. subtilis, pero también hay variaciones significativas del genoma. El análisis comparativo mostró que el genoma de la cepa DM2 codifica algunas proteínas específicas de la cepa en comparación con B. subtilis subsp. subtilis str. 168, como la proteína de la familia de la carboximuconolactona descarboxilasa, las oxidorreductasas de la familia gfo/Idh/MocA, la proteína de membrana de respuesta al estrés de la familia GlsB/YeaQ/YmgE, los transportadores de la familia HlyC/CorC, la oxidorreductasa dependiente de flavina de la clase LLM y la proteína que contiene el dominio de anclaje de la pared celular LPXTG. La mayoría de las proteínas comunes específicas de las cepas DM2 y MJ01, o las proteínas exclusivas de la cepa DM2, están implicadas en las vías relacionadas con la respuesta al estrés, la señalización y la degradación de hidrocarburos. Además, el genoma de la cepa DM2 contiene 122 genes que codifican sistemas desarrollados de dos componentes y 138 genes que codifican sistemas transportadores ABC. Las características prominentes del genoma de la cepa DM2 reflejan la aptitud evolutiva de esta cepa a las duras condiciones y a la utilización de hidrocarburos.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:B. subtilis subsp, cepa DM2 genoma, cepa DM2, genes, genoma, proteínas específicas, Bacillus subtilis cepa DM2, dominio de anclaje de la pared celular LPXTG, proteína de membrana de respuesta al estrés de la familia YmgE, sistemas transportadores ABC
• Keywords:B. subtilis subsp, strain DM2 genome, strain DM2, genes, genome, specific proteins, Bacillus subtilis strain DM2, LPXTG cell wall anchor domain, YmgE family stress response membrane protein, ABC transporter systems