Resumen

La secuenciación de próxima generación ha descubierto nuevas clases de pequeños ARN (ARNs) en eucariotas, además de los conocidos miARN, siARN y piARN. En concreto, las especies de sRNAs surgen de los sitios de inicio de la transcripción (TSSs) y de los sitios de terminación de la transcripción (TTSs) de los genes. Sin embargo, aún falta una caracterización detallada de estas nuevas clases de sRNAs. Aquí presentamos un estudio exhaustivo de los sRNAs derivados de los TTSs de genes expresados (TTSa-RNAs) en líneas celulares humanas y tejidos primarios. Aprovechando la secuenciación de sRNAs, demostramos que los TTSa-RNAs están presentes en los núcleos de las células humanas, se cargan tanto en AGO1 como en AGO2, y su biogénesis no requiere la actividad endonucleolítica de DICER y AGO2. Los TTSa-RNAs muestran un fuerte sesgo hacia un residuo G en la primera posición en el extremo 5′, una característica conocida de los sRNAs unidos a AGO, y una peculiar cola oligoA en el extremo 3′. Los ARN-TTSa unidos a AGO derivan de genes implicados en la regulación de la progresión del ciclo celular y en puntos de control de la integridad del ADN. Por último, aportamos pruebas de que los ARN-TTSa pueden detectarse mediante sRNA-Seq en tejidos humanos primarios, y de que su expresión aumenta en muestras tumorales en comparación con tejidos no tumorales, lo que sugiere que en el futuro los ARN-TTSa podrían explorarse como biomarcadores para el diagnóstico o el pronóstico de tumores malignos humanos.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:TTSa, RNAs, sRNAs, genes, regulación de la progresión del ciclo celular, puntos de control de la integridad del ADN, líneas celulares humanas, cola oligoA peculiar, tejido humano primario, sitios de inicio de la transcripción.
• Keywords:TTSa, RNAs, sRNAs, genes, cell cycle progression regulation, DNA integrity checkpoints, human cell lines, peculiar oligoA tail, primary human tissue, transcription start sites