Resumen

La identificación y caracterización de los complejos proteicos implicados en los datos de interacción proteína-proteína son cruciales para la comprensión de los eventos moleculares en condiciones fisiológicas normales y anormales. Este artículo ofrece una novedosa caracterización de los subcomplejos en las bases de datos de interacciones proteicas, haciendo hincapié en cuestiones de definición y representación, cuantificación, validación biológica, métricas de red, motivos, modularidad y términos de ontología genética (GO). El artículo introduce el concepto de "grupo anidado" como forma de representar los subcomplejos y estima que alrededor del 15% de esos grupos anidados con el mayor índice de Jaccard pueden ser resultado de artefactos de datos en las bases de datos de interacción de proteínas, mientras que un número de ellos puede encontrarse en estructuras modulares biológicamente importantes o en estructuras dinámicas. También descubrimos que las centralidades de la red, el enriquecimiento en proteínas esenciales, los términos GO relacionados con la regulación, los motivos imperfectos de 5 cliques y la mayor homogeneidad GO pueden utilizarse para identificar proteínas en complejos anidados.

• Materias:Bioquímica Proteínas Diabetes - Aspectos nutricionales Plantas medicinales Diabetes Técnica In Vitro
• Subjects:Biochemistry Proteins Diabetes - Nutritional aspects Medicinal plant Diabetes In Vitro Technique
• Palabras claves:base de datos de interacción de proteínas, grupo anidado, mayor índice jaccard, mayor homogeneidad go, caracterización de proteínas, resultados de datos, datos de interacción de proteínas, caracterización de subcomplejos, estructura modular importante, condiciones fisiológicas anormales
• Keywords:protein interaction database, nested group, higher jaccard index, higher go homogeneity, characterization of protein, results of data, protein interaction data, characterization of subcomplexes, important modular structure, abnormal physiological conditions