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Genome-Wide Characterization and Expression Profiles of the Superoxide Dismutase Gene Family in GossypiumCaracterización de todo el genoma y perfiles de expresión de la familia de genes de la superóxido dismutasa en Gossypium

Resumen

La superóxido dismutasa (SOD), como grupo de enzimas importantes y ubicuas, desempeña una función crítica en el crecimiento y desarrollo de las plantas. Anteriormente, esta familia de genes se había investigado en Arabidopsis y arroz, pero aún no se había caracterizado en algodón. En nuestro estudio, fue la primera vez que realizamos un análisis de todo el genoma de la familia de genes SOD en el algodón. Nuestros resultados mostraron que se identificaron 10 genes de la familia de genes SOD en Gossypium arboreum y Gossypium raimondii, incluyendo 6 Cu-Zn-SODs, 2 Fe-SODs y 2 Mn-SODs. El análisis de la distribución cromosómica reveló que los genes SOD se distribuyen en 7 cromosomas en Gossypium arboreum y 8 cromosomas en Gossypium raimondii. La duplicación segmentaria es el evento de duplicación predominante y el principal contribuyente a la expansión de la familia de genes SOD. La estructura génica y el análisis de la estructura proteica mostraron que los genes SOD conservan la disposición exón/intrón y la composición de motivos. El análisis de expresión basado en microarrays reveló que los genes SOD tienen una función importante en el estrés abiótico. Además, el perfil de expresión específico de tejido revela la divergencia funcional de los genes SOD en el desarrollo de diferentes órganos del algodón. En conjunto, este estudio ha aportado nuevos conocimientos sobre las funciones putativas de la familia de genes SOD en el algodón. Los resultados de la presente investigación podrían ayudar a comprender el papel de la familia de genes SOD en diversos aspectos del ciclo vital del algodón.

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