La resistencia a las fluoroquinolonas afecta de forma diferente a la producción de toxinas de las cepas de Clostridium perfringens. Para investigar el efecto de la selección de la resistencia a las fluoroquinolonas en los cambios globales de las actividades metabólicas y las susceptibilidades a los fármacos, se compararon cuatro cepas de C. perfringens y sus mutantes resistentes a la norfloxacina, la ciprofloxacina y la gatifloxacina en casi 2000 ensayos, utilizando placas de microarrays de fenotipos. Se observaron variaciones entre las cepas mutantes resultantes de la selección de resistencia en todos los aspectos del metabolismo. La utilización del carbono, el intervalo de pH, la tolerancia osmótica y la sensibilidad química de las cepas resistentes se vieron afectadas de forma diferente en los mutantes resistentes dependiendo tanto del genotipo bacteriano como de la fluoroquinolona a la que la bacteria era resistente. Aumentó la sensibilidad a la gentamicina y la eritromicina de todos los mutantes resistentes excepto uno, pero algunas cepas resistentes fueron menos sensibles a la amoxicilina, la cefoxitina, la ceftriaxona, el cloranfenicol y el metronidazol que sus tipos silvestres. La sensibilidad al bromuro de etidio disminuyó en algunos mutantes resistentes y aumentó en otros. El análisis de microarrays de dos mutantes resistentes a la gatifloxacina mostró cambios en las actividades metabólicas que se correlacionaron con la expresión alterada de varios genes. Tanto las estructuras químicas de las fluoroquinolonas como la composición genómica de los tipos silvestres influyeron en los cambios hallados en los mutantes resistentes, lo que puede explicar algunos informes incoherentes sobre los efectos del uso terapéutico de fluoroquinolonas en aislados clínicos de bacterias.
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